Van 2001 tot en met 2005 is Koert werkzaam geweest als manager binnen de economische onderzoeks- en adviesgroep van PricewaterhouseCoopers Corporate Finance NV, waar hij zich heeft gespecialiseerd in mededingingsvraagstukken, staatssteun, industrial organisation en markt- en vraaganalyses. Sinds september 2005 is Koert als senior onderzoeker verbonden aan SEO Economisch Onderzoek.

Koert heeft uitgebreide ervaring met onderzoek en advies op het gebied van marktwerking in het algemeen, en op het gebied van staatssteun en Markt&Overheid in het bijzonder. Hij adviseert en ondersteunt diverse corporate klanten in binnen- en buitenland met economisch onderzoek in mededingings- en staatssteunzaken. Daarnaast doet hij onderzoek op het gebied van staatssteun, Markt&Overheid, mededinging en regulering voor ministeries in Nederland en in het buitenland, de Europese Commissie, centrale banken en mededingingsautoriteiten. Zijn sectorspecialisaties betreffen de volgende sectoren: Openbaar Vervoer&Transport, Zorg, Onderwijs en de Financiële sector.

In z’n proefschrift onderzoekt Koert de effecten van staatssteun op concurrentie, in het bijzonder de omstandigheden die van invloed zijn op het verstorende karakter van staatssteun. Staatssteun aan zogenaamde Diensten van Algemeen Economisch Belang en staatssteun aan R&D hebben daarin bijzondere aandacht. Daarnaast geeft hij doctoraalcolleges over staatssteun en concurrentie. Vanwege het vertrouwelijke karakter van het uitgevoerde werk in staatssteunzaken staan deze niet alle, of niet volledig met alle details, in aangehecht publicatieoverzicht genoemd.

Momenteel werkt Koert op een tijdelijke opdracht op de Nederlandse Antillen waar hij - in het kader van de nieuwe staatkundige structuur - de ontmanteling van het land Nederlandse Antillen coordineert. Deze opdracht voert hij uit in dienst van de Nederlandse Vertegenwoordiging te Willemstad en loopt tot medio 2010. Daarnaast is Koert part-time in dienst van SEO Economisch Onderzoek en in beperkte mate en op ad-hoc basis beschikbaar voor economisch onderzoek en advies.